O processamento de documentos acadêmicos é executado principalmente, pela Divisão de Controle Acadêmico (DICOA).

Os principais documentos processados nesse setor são equivalências de disciplina individuais, dispensas de disciplina e aproveitamento de créditos, dilação de prazo, regime especial de aprendizagem, abreviação de tempo de curso, migração curricular, mudança de turno, opção e reopção de curso. 

Além desses trabalhos, a DICOA oferece suporte às Coordenações dos cursos na alocação docente, matrículas (graduação, pós-graduação, aluno especial e pós-doutorado) extemporâneas e oferta de disciplina.